Dr. Carlos Ordóñez se graduó en Biología en la Universidad de Alcalá, y realizó el Máster en Virología de la Universidad Complutense de Madrid en 2015. Posteriormente, defendió su tesis doctoral en 2022 bajo la supervisión de la Dra. Margarita Salas en el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. El trabajo doctoral se centró en la caracterización de ADN polimerasas para desarrollar nuevos métodos de amplificación de ADN.
Tras el doctorado, realizó su primer postdoctorado en el laboratorio del Dr. Miguel de Vega, también en el Centro de Biología Molecular. Allí estudió nuevas ADN polimerasas en el modelo bacteriano gram-positivo Bacillus subtilis. En 2023, se unió al grupo de Biología Sintética dirigido por el Prof. Raúl Pérez Jiménez en CIC bioGUNE. Actualmente está trabajando en la aplicación de técnicas de reconstrucción de enzimas ancestrales en la edición y replicación genómica. También está involucrado en un proyecto enfocado en la degradación de biomateriales.